Компания обслуживает 40 городов в 15 странах и фокусируется на прямых рейсах, высоком качестве услуг и дешевых авиабилетах.
Программа рейсов авиакомпании включает прямые перелеты в ряд городов России из Салоник, Афин, Корфу, Закинтоса и Ираклиона, а также в ряд городов Украины из Салоник, Корфу и Ираклиона.
Ираклион также связан направлениями авиакомпании с Бухарестом и Белградом.
Кроме того, рейсы из Салоник и Ираклиона будут осуществляться в Варшаву и Катовице. Ираклион также послужит базой Ellinair для прямых рейсов во Франкфурт, Мюнхен, Дюссельдорф, Берлин, Ганновер, Гамбург и Лейпциг.
Авиакомпания планирует расширить количество рейсов на ближайший летний сезон, о чем сообщит в ближайшем будущем.